C'est le printemps, en avril, et les dernières fleurs de cerisier sont encore en fleur. Ce rat de bibliothèque d'ordinaire distant, qui ne s'intéresse guère aux autres, tombe sur un livre dans la salle d'attente d'un hôpital. Sur la couverture, on peut lire les mots écrits à la main : « Vivre avec la mort ». Il découvre rapidement qu’il s’agit du journal intime de sa camarade de classe très populaire et d’une gaieté authentique, Sakura Yamauchi, qui lui révèle qu’elle souffre secrètement d’une maladie du pancréas et qu’il ne lui reste plus que peu de temps à vivre. C’est à ce moment-là qu’elle trouve une personne de plus avec qui partager son secret.
S'efforçant de mener une vie aussi normale que possible, Sakura est déterminée à vivre pleinement jusqu'à son dernier jour. Alors que son esprit libre et ses actions imprévisibles le déconcertent, son cœur commence peu à peu à changer.