Kurokami Medaka, élève de première année, est élue présidente du conseil des élèves, et la première chose qu’elle fait est d’installer une boîte à suggestions, que les élèves surnommeront plus tard la « Medaka Box ». Medaka encourage les élèves à y déposer sans hésitation tout problème et promet de se saisir de n’importe quelle question, quelle que soit la personne qui la soulève.
Comme Medaka a remporté les élections du conseil des élèves avec un score impressionnant de 98 % des voix, elle se retrouve seule membre du conseil. Elle demande de l'aide à son ami d'enfance, Hitoyoshi Zenkichi, qui accepte à contrecœur, devenant ainsi le membre le moins gradé du conseil des élèves. Medaka recrute rapidement deux autres personnes au sein du conseil : l'ancien membre du club de judo Akune Kouki, en tant que secrétaire, et l'actuelle membre du club de natation Kikaijima Mogana, engagée pour 300 yens par jour, en tant que trésorière.
Désormais, les membres du Conseil des élèves passent leurs journées à résoudre les problèmes soumis via la Medaka Box, qu'il s'agisse de voyous dans des clubs auxquels ils n'appartiennent pas, de filles ayant besoin d'aide pour rédiger des lettres d'amour ou de personnes ayant perdu leurs animaux de compagnie, gagnant peu à peu le respect et l'admiration de toute l'école.
Chapitres inclus :
le volume 15 contient le gaiden « Good Loser Kumagawa » (グッドルーザー球磨川) ; Jump NEXT (26/12/2011)
Le volume 22 contient le gaiden « Good Loser Kumagawa Final » (完結編).