Hodaka, un lycéen, quitte son île isolée pour s’installer à Tokyo, mais se retrouve aussitôt sans le sou. Il mène une vie solitaire, mais finit par décrocher un emploi de rédacteur pour un magazine occulte peu recommandable. Dès qu’il commence à travailler, le temps devient pluvieux, jour après jour. Dans un coin de cette ville bondée et animée, Hodaka rencontre une jeune femme nommée Hina. En raison de certaines circonstances, Hina et son petit frère vivent ensemble, mais mènent une vie joyeuse et solide. Hina possède également un certain pouvoir : celui d’arrêter la pluie et de dégager le ciel.