Freesia se déroule dans une société japonaise alternative en guerre, où une loi autorisant les meurtres par vengeance a été adoptée. Si quelqu’un tue un de vos proches, vous êtes légalement autorisé à tuer le coupable, ou à engager quelqu’un pour le faire. Le manga suit les aventures d’un personnage qui travaille pour une agence spécialisée dans ces meurtres par vengeance.